Plačilo za koncesijo znaša 3% prihodkov iz tarife za uporabnike in je prihodek Ekološko razvojnega sklada RS. Način plačila za koncesijo se podrobneje določi s koncesijsko pogodbo.
Če iz poslovnega poročila koncesionarja za preteklo leto sledi, da so letni stroški koncesionarja iz 31. člena te uredbe večji od pričakovanega plačila za storitve javne službe v istem obdobju, ki se ga izračuna na podlagi podatkov o prevzetih količinah odpadkov in tarife za ceno storitev iz 32. člena te uredbe, lahko izjemoma koncedent za tekoče koledarsko leto zniža plačilo za koncesijo.