Sekundariju daje plačo za njegovo delo zavod oziroma zdravnik v zasebni zdravstveni dejavnosti, pri katerem se sekundarij usposablja.
Zdravstveni zavod ali zdravnik v zasebni zdravstveni dejavnosti, ki usposablja sekundarija, ima pravico do povrnitve stroškov, ki jih ima z usposabljanjem.
Povračilo plač in drugih stroškov zagotavlja Ministrstvo za zdravstvo iz proračuna skladno z zakonom in kolektivno pogodbo.