Zbiranje prijav, koordinacija in razporejanje sekundarijev, nadzor nad potekom sekundariata in evidentiranje prekinitev sekundariata sodi med javna pooblastila, ki jih izvaja zbornica:
Zbornica o uskladitvi prijav z razpoložljivimi mesti za opravljanje sekundariata ter o izboru kandidatov s strani delodajalcev obvesti zdravnike sekundarije v 21 dneh po preteku prijavnega roka.
Kandidatom, ki niso bili izbrani, posreduje zbornica seznam še razpoložljivih prostih delovnih mest, na katera se lahko prijavijo do 1. januarja, 1, maja oziroma 1. septembra za cikluse ki pričenjajo mesec dni kasneje.
O ponovnem izboru morajo biti sekundariji obveščeni najmanj 14 dni pred nastopom dela.