Agencija opravlja kot dejavnost v javnem interesu naslednje naloge:
1.
dodeljevanje vlakovnih poti;
2.
določanje metodologije zaračunavanja uporabnine;
3.
zaračunavanje uporabnine za uporabo javne železniške infrastrukture;
4.
sklepanje okvirnih pogodb s prosilci o določitvi značilnosti infrastrukturnih zmogljivosti;
5.
obdelava podatkov za potrebe zaračunavanja uporabnine;
6.
izvajanje nadzora nad zbiranjem podatkov za zaračunavanje uporabnine;
7.
izvajanje nadzora nad realizacijo plačila uporabnine;
8.
izvajanje nadzora nad realizacijo odobrenih vlakovnih poti;
9.
sprejem voznega red omrežja, pri čemer sodeluje z dodeljevalnimi organi in upravljavci železniških omrežij drugih držav v cilju usklajenega dodeljevanja vlakovnih poti;
10.
sodelovanje v mednarodnih in drugih organizacijah zaradi učinkovitega in racionalnega dodeljevanja vlakovnih poti in zaračunavanja uporabnine;
11.
sodelovanje pri pripravi in spremembah Programa omrežja Republike Slovenije;
12.
opravlja naloge varnostnega organa, kot jih določa zakon;
13.
dodeljevanje, preklic ali začasen odvzem licence;
14.
izvajanje nadzora nad veljavnostjo in izpolnjevanjem pogojev za izdajo licenc, varnostnih spričeval in varnostnih pooblastil;
15.
spremljanje, pospeševanje, uveljavljanje in razvijanje varnostno regulativnega okvirja in sistema nacionalnih varnostnih predpisov, kar obsega tudi pripravo predlogov podzakonskih predpisov s področja varnosti železniškega prometa;
16.
izvajanje ukrepov v zvezi z uporabo TSI (tehnične specifikacije interoperabilnosti);
17.
izdaja, posodabljanje, zagotavljanje dvojnikov, začasen preklic in odvzem dovoljenja izvršilnim železniškim delavcem;
18.
vodenje, objava in posodabljanje registra izdanih dovoljenj izvršilnim železniškim delavcem in registra subjektov usposabljanja;
19.
kontrola izdanih dovoljenj in spričeval na celotnem področju javne železniške infrastrukture v Republiki Sloveniji;
20.
nadzor rednih preverjanj telesnih in duševnih sposobnosti in stalnih strokovnih usposabljanj izvršilnih železniških delavcev;
21.
izdaja, začasen preklic ali odvzem pooblastila subjektom usposabljanja izvršilnih železniških delavcev;
22.
zagotavljanje stalnega nadzora v zvezi z usposabljanjem, ocenjevanjem sposobnosti, posodabljanjem dovoljenj in spričeval, ki so že zajeta v sistemu varnega upravljanja;
23.
izvajanje ukrepov v zvezi z realizacijo sklepov iz varnostnih priporočil;
24.
vodenje nacionalnega registra tirnih vozil;
25.
izvajanje drugih nalog, določenih s predpisi;
26.
izvajanje ostalih nalog v javnem interesu.
Z izvajanjem nalog v javnem interesu agencija zagotavlja:
- nediskriminatoren dostop do javne železniške infrastrukture;
- enotno zaračunavanje uporabnine;
- učinkovitost mednarodnih vlakovnih poti;
- konkurenčnost mednarodnega tovornega prometa;
- nediskriminatornost izvajanja potniškega prometa;
- razvoj varnostnega regulativnega okvirja;
- enoten nacionalni register tirnih vozil.
Za izvrševanje javnih pooblastil sprejema agencija skladno s predpisi splošne akte. Agencija izdaja posamične upravne akte, s katerimi odloča o upravnih stvareh iz svojega delovnega področja.
Za namene poročanja Evropski železniški agenciji agencija objavi letno poročilo o svoji dejavnosti v prejšnjem letu in ga pošlje Evropski železniški agenciji najkasneje do 30. septembra tekočega leta. Poročilo mora vsebovati informacije o:
-
razvoju varnosti na železnici, vključno z združevanjem skupnih varnostnih kazalnikov iz Priloge I Direktive 2004/49/ES Evropskega parlamenta in Sveta z dne 29. aprila 2004 o varnosti na železnicah Skupnosti ter o spremembi Direktive Sveta 95/18/ES o izdaji licence prevoznikom v železniškem prometu in Direktive 2001/14/ES o dodeljevanju železniških infrastrukturnih zmogljivosti, naložitvi uporabnin za uporabo železniške infrastrukture in podeljevanju varnostnega spričevala (Direktiva o varnosti na železnicah; UL L št. 164 z dne 30. 4. 2004, str. 44), zadnjič spremenjene z Direktivo Komisije 2009/149/ES z dne 27. novembra 2009 o spremembi Direktive 2004/49/ES Evropskega parlamenta in Sveta glede skupnih varnostnih kazalnikov in skupnih metod za izračun stroškov nesreč (UL L št. 313 z dne 28. 11. 2009, str. 65), na ravni držav članic Evropske skupnosti;
-
pomembnih spremembah zakonodaje in ureditve v zvezi z varnostjo na železnici;
-
spremembah pri podeljevanju varnostnega spričevala in varnostnega pooblastila;
-
rezultatih in izkušnjah v zvezi z nadzorom nad upravljavci železniške infrastrukture in prevozniki v železniškem prometu.«.