Register vojaških zrakoplovov vodi Uprava za logistiko ministrstva v skladu s predpisi, ki urejajo registracijo in označevanje državne pripadnosti vojaških zrakoplovov. Kopijo registra vojaških zrakoplovov hrani Generalštab Slovenske vojske.
Register vojaških zrakoplovov je zaupen in se označuje s stopnjo zaupnosti “obramba, vojaška skrivnost, strogo zaupno”.
Register vojaških zrakoplovov ustanovi minister.