Za izvajanje javne službe se na Inštitutu oblikujejo programske skupine.
Inštitut opravlja dejavnost tudi za druge naročnike v obsegu in na način določen z letnim programom dela Inštituta, ki je usklajen s Programom dela Inštituta.
Inštitut opravlja naloge monitoringa v skladu z letnimi programi monitoringa, ki jih pripravi ministrstvo, pristojno za okolje in prostor. Medsebojna razmerja med Inštitutom in ministrstvom, pristojnim za okolje in prostor, se podrobneje uredijo s pogodbo.
Inštitut opravlja naloge monitoringa GSO v skladu z letnimi programi monitoringa GSO, ki jih pripravi ministrstvo, pristojno za okolje in prostor. Medsebojna razmerja med Inštitutom in ministrstvom, pristojnim za okolje in prostor, se podrobneje uredijo s pogodbo.