Zavod izvaja dejavnost obveznega in prostovoljnega zdravstvenega zavarovanja in opravlja druge dejavnosti v skladu z zakonom in svojimi splošnimi akti.
Dejavnost Zavoda je zlasti da:
1.
sodeluje pri pripravi plana zdravstvenega varstva ter pri tem zastopa interese zavarovancev in delodajalcev;
2.
določa podrobnejši obseg pravic iz zdravstvenega zavarovanja;
3.
sodeluje pri dogovorih o programu storitev obveznega zdravstvenega zavarovanja, opredelitvi zmogljivosti in določitvi obsega sredstev za ta namen;
4.
zagotavlja nadzor nad obračunavanjem in plačevanjem prispevkov ter izterjavo zapadlih prispevkov za obvezno zdravstveno zavarovanje;
5.
sklepa pogodbe za opravljanje zdravstvenih storitev, plačuje račune opravljenih zdravstvenih storitev ter nadzira uresničevanje pogodb;
6.
rešuje zahtevke za uveljavljanje in varstvo pravic iz obveznega in prostovoljnega zdravstvenega zavarovanja;
7.
izvaja obvezno zdravstveno zavarovanje po mednarodnih konvencijah;
8.
vzpostavlja in vodi podatkovne baze in evidence ter zalaga in prodaja obrazce in listine za izvajanje zdravstvenega zavarovanja in opravlja drugo založniško in izdajateljsko dejavnost za informiranje javnosti;
9.
nudi pravno in drugo strokovno pomoč zavarovanim osebam ter opravlja druga administrativna, tehnična in tem podobna dela.
Zavod lahko opravlja dela tudi za druge organizacije, če ima zato proste zmogljivosti, in če je narava dela v skladu z dejavnostjo Zavoda. Posamezna dela iz svoje dejavnosti pa lahko Zavod tudi prenese na druge organizacije, če jih ne more bolj racionalno opraviti sam.