Direktor je lahko razrešen pred iztekom mandata v primerih, ki so določeni v zakonu o zavodih (na njegovo lastno zahtevo ali iz krivdnih razlogov) ali če tako zahteva ustanovitelj (iz krivdnih ali nekrivdnih razlogov).
V primeru predčasne razrešitve iz krivdnih razlogov direktorju ne pripada odpravnina, preneha pa mu tudi delovno razmerje v zavodu.
Svet zavoda mora pred sprejemom sklepa o razrešitvi direktorja iz krivdnih razlogov seznaniti direktorja z razlogi za razrešitev in mu dati možnost, da se o njih izjavi.
V primeru predčasne razrešitve direktorja, svet zavoda, po predhodnem soglasju ustanovitelja v imenu katerega poda soglasje župan, imenuje vršilca dolžnosti direktorja, vendar najdlje za dobo enega leta.