V delovno področje Republiške carinske uprave spadajo zadeve carinskega nadzora, carinjenja blaga in storitev, kontrole blaga, katerega uvoz oziroma izvoz sta posebej urejena, devizno-valutne kontrole v mednarodnem potniškem in obmejnem prometu s tujino, preprečevanje in odkrivanje carinskih prekrškov ter vodenje upravnega postopka na prvi in drugi stopnji in postopka za prekrške na prvi stopnji, preprečevanje in odkrivanje kaznivih dejanj in gospodarskih prestopkov v carinskem postopku, preprečevanje in odkrivanje deviznih prekrškov v mednarodnem potniškem in obmejnem prometu s tujino ter obdelava in spremljanje evidenčnih in statističnih podatkov o uvozu in izvozu.
V delovno področje Republiške carinske uprave spada tudi opravljanje zadev s področja nadzora prehajanja čez državno mejo, naloge v zvezi z ugotavljanjem mejnih incidentov in drugih kršitev nedotakljivosti državne meje na mejnem prehodu ter skrb za izvajanje predpisov s področja tujcev in mednarodnih sporazumov, ki urejajo prehajanje čez državno mejo, na mejnih prehodih, za katere Vlada Republike Slovenije določi, da enote republiškega organa za notranje zadeve na njih ne opravljajo kontrole prehajanja čez državno mejo (v nadaljnjem besedilu: mejni prehodi, ki jih določi Vlada).
Ne glede na pooblastila iz prejšnjega odstavka, sme ministrstvo, pristojno za notranje zadeve, uporabiti enote organa za notranje zadeve, določene za kontrolo prehajanja čez državno mejo, če je to potrebno iz varnostnih razlogov , predvsem zaradi varnosti državne meje in odkrivanja in preprečevanja kaznivih dejanj. O tem mora predhodno obvestiti pristojni carinski organ, kolikor zaradi nevarnosti odlašanja ni potrebno takojšnje ukrepanje.