Agencija opravlja zadeve, ki se nanašajo na izvajanje ukrepov in nalog na področju kmetijstva, živilstva in ribištva v skladu s skupno kmetijsko in ribiško politiko Evropske unije ter na druge naloge za izvajanje reforme kmetijske politike.
Sredstva za izvajane ukrepov in nalog na področju kmetijstva, živilstva in ribištva se črpajo iz Evropskega kmetijskega usmerjevalnega in jamstvenega sklada (EKUJS), ki je sestavni del splošnega proračuna Evropskih skupnosti in se uporablja za financiranje skupne kmetijske politike.