Izvajanje referenduma vodijo volilne komisije referendumskih območij in volilni odbori.
Republiška volilna komisija nadzoruje zakonitost izvedbe referenduma.
Volilne komisije referendumskih območij imenuje skupščina občine, v kateri je referendumsko območje oziroma njegov pretežni del.
Volilna komisija referendumskega območja določi volišča za izvedbo referenduma in imenuje volilne odbore.
Občinske skupščine imenujejo volilne komisije referendumskih območij v 5 dneh po razpisu referenduma. Če tega ne storijo, imenuje volilne komisije referendumskih območij republiška volilna komisija.