Sklad spremlja uresničevanje investicijskih načrtov na osnovi sklenjenih pogodb in v odvisnosti od oblike financiranja oziroma udeležbe sklada.
Kontrola sklada je upravno-pravna, tehnično-tehnološka in finančna.
Kontrola poteka praviloma v skladu z določili pogodbe med skladom in prosilcem. Poslovni načrt mora biti definiran kot priloga in kot sestavni del pogodbe.
Ne glede na določila posamezne pogodbe mora sklad najmanj enkrat v polletju preizkusiti izvajanje pogodbe po upravno-pravni, tehnično-tehnološki in finančni plati.