Vlada v roku 30 dni od uveljavitve tega zakona uskladi Sklep o organizaciji in delu javnega zavoda Kobilarna Lipica (Uradni list RS, št. 1/08) s tem zakonom.
Vlada najpozneje v treh mesecih od uveljavitve tega zakona na novo imenuje člane sveta Kobilarne Lipica, do takrat pa funkcijo organa upravljanja opravlja svet Kobilarne Lipica, katerega člani so bili imenovani s sklepom Vlade Republike Slovenije št. 01415-43/2013/11 dne 24. julija 2014. Tem mandat preneha z dnem imenovanja novih članov sveta Kobilarne Lipica.
Vlada v 15 dneh od uveljavitve tega zakona s sklepom prenese vse nepremičnine in osnovna sredstva z zavarovanega območja, katerih upravljavec je ministrstvo, pristojno za kmetijstvo, v upravljanje ministrstvu, pristojnemu za turizem, kar vključuje tudi prenos vseh nepremičnin in osnovnih sredstev z zavarovanega območja ter tistih, ki jih Kobilarna Lipica upravlja in uporablja zunaj zavarovanega območja, v premoženjske knjige ministrstva, pristojnega za turizem.
Ministrstvo, pristojno za turizem, vstopi v vse najemne pogodbe, ki jih je sklenilo ministrstvo, pristojno za kmetijstvo, na podlagi 6. člena Zakona o spremembah in dopolnitvah Zakona o Kobilarni Lipica (Uradni list RS, št. 19/14).