Predlagatelj, ki meni, da njegov predlog iz neupravičenih razlogov ni bil izbran, lahko v petnajstih dneh po prejemu sklepa iz drugega odstavka 18. člena tega pravilnika vloži na ministrstvo pisni ugovor.
Predlagatelj mora v ugovoru natančno opredeliti razloge, zaradi katerih vlaga ugovor. Predmet ugovora ne morejo biti predpisana merila in kriteriji za ocenjevanje vlog za dodelitev sredstev.
Strokovna skupina obravnava ugovor, minister pa v roku 21 dni odloči z odločbo.
Zoper odločbo ministra o ugovoru ni možna pritožba, možen pa je upravni spor.